たぶん、隙間とそれ以上近づかないことに疑問を感じられていると理解して、補足説明。
磁石や静電気を帯びたものが引力や反発を起こすのと同じ力が理由で、原子同士が一定の距離以上に近づけるには大きな力を必要とします。

消しゴムや磁石自体が形を成しているのも、電磁気力によります、原子核の大きさを人間くらいだと考えると、隣の原子核は１ＫＭぐらい離れた場所にあります。
すっかすかなのです＾＾。

なぜ物がばらばらにならないのか、逆にすべてごちゃっとくっついてしまわないのかを理解するには、量子論を学ぶ必要があります。
ちなみに量子論って．．摩訶不思議．．ＳＦ映画をはるかに凌駕するぶっ飛びようでですが、実験に基づき数学により積み上げられた理論です　難しい！