>>564
whichは余分でした。

sumの方がrleより高速だと思ったらから、すべて０の場合はrleを呼ばないことにしただけ。
0連続でやるとこれだけ差がつく。

rle01 <- function(x){ # c(0,1,1,1,0,0) => return 3
if(sum(x)==0) return(0) #c(0,0,0,0,0,0) => return 0
else{
r=rle(x) # Run Length Encoding
max(r$lengths[which(r$values==1])] # max length of value 1
}
}
rle012 <- function(x) {
r <- rle(x)
one <- r$values == 1
if (any(one)) max(r$length[one]) else 0
}

> x=rep(0,1e8)
> system.time(rle01(x))
user system elapsed
0.3 0.0 0.3
> system.time(rle012(x))
user system elapsed
7.36 4.52 13.25
>