野依氏は、まだ3年も任期があったし、長年の悲願だった特定研究開発法人の指定の先行きが見通せない状況では辞任する意志はなかったのではないかな？野依氏自身が言っていたように一研究者の不正事件で普通は組織のトップが辞任することはないわけだしね。