長距離トラック運転手の円盤（まどか・ばん）はある深夜、田舎の国道で大型トラックを飛ばしているとUFOを目撃
そこでぷっつりと記憶が消えていた・・・
後日、逆光催眠で記憶を取り戻した彼は小人型宇宙人たちによって円盤に拉致され、仮面ライダーに改造されていた事実を知る
牛を生きたまま解剖する悪の集団キャトルミューティレーターを相手に仮面ライダーUFOは戦うのだ！