そんなこともわからない段階なのであれば、
指導者に指導を仰ぐべき
編集者や印刷所に迷惑かけんな

著者校正の目的を理解できてるか?
基本的には版組時の間違いをチェックするための作業だよ
受理時の原稿どおりに版組されているのかどうかをチェックする
単語を入れ替えるなんてのはやっちゃダメ

指定の仕方は、基本伝わればOKだが
普通は書き方の指示もゲラと一緒に来る