質問が意味不明だな

水や酸素の循環のためにはコロニーに
大規模な擬似生態系を作らなければならないのか

というテーマだったのが
ただの精神衛生上の問題にすり替えられ矮小化されてる

それに対する回答は、人間の目が届く狭い範囲の動植物を再現しても生態系規模には足りないし、そんな装飾程度なら観葉植物で十分だろということ

コロニーの人口密度を考えたら大規模な生態系の再現は難しく、ミニチュアの圧縮効率化した生態系ではその中に人間が住めるようなものにはならないだろう