機械出身のため全然わかっておらずお恥ずかしいのですが、
FFT→ローパスフィルター→逆FFT
やってノイズ除去するとき、サンプル数は常識的に幾つ以上とかあるのでしょうか？
20個や60個のサンプリングデータ数でFFTやるってアホなこといってますか？