申請窓口が異なりますから、同時に申請することはできません。それぞれの窓口で別個に申請してください。
これはほかの道府県でも同様です。人間用医薬品販売業開設の申請と動物用医薬品販売業開設の申請を同時に受け付けている窓口はありません。
また、「無条件で」許可されるということもありません。区画や貯蔵設備を新たに設置する必要もあります。