Bクジラは指導、学習、協力、計画、苦悩することで知られている。多くのクジラ種の新皮質は、
2007年以前はヒト科のみに存在するとされた細長い紡錘形神経細胞に存在する。
人間ではこれらの神経細胞は社会的接触、情動、判断、精神理論に関連する。クジラの紡錘形神経細胞は、
人間の紡錘形神経細胞の位置に相当する脳部分にあり、同様の機能を有すると考えられる。
人間が間接的にクジラの脅威になることがある。クジラやその他の海洋哺乳類の死の大きな原因に
刺し網や巻き網漁がある。アカボウクジラは漁網に頻繁に絡まる。クジラはまた海洋汚染にも影響される。
これらの動物は食物連鎖で上位にあり、大量の有機薬品が体内に蓄積しやすい。特にハクジラは
ヒゲクジラと比較して食物連鎖の上位にあるため多量の脂肪層を有し、母親の毒素が授乳により
子クジラに伝達されることがある。これらの汚染物質は胃腸ガンを起こしたり、感染病にかかりやすく
なる体質を形成したりする。またプラスチックの袋などの廃棄物を飲み込み、汚染されることがある。
環境保護論者は高度な海軍のソナーがクジラを危険にさらすと考える。科学者の中には、クジラが
減圧障害を経験する症候を指摘し、ソナーがクジラの浜辺乗り上げを引き起こすことを示唆する者もいる。