たかだか、1200枚なら 
1800*900*600の書棚1本で楽に収まると思うけど?
無圧縮のCDのイメージでHDDに保管するとして、
1Tもあれば、1800〜1600枚位は楽にバックアップは取れるよ。
必要なら、CD−Rに焼く。

後は、オリジナルのCDはCD用のコンテナに入れて保存に適した安定した環境で保管すること。