日蓮のご本尊の神は天台系でなく、真言系の神。

http://d.hatena.ne.jp/nisinojinnjya/20071020
三社託宣とは、中世から近世にかけて流布した、天照皇大神、八幡大菩薩（八幡大神）、 春日大明神の三神の託宣（神の意思やお告げ）の事をいい

鎌倉時代以降に、両部神道（真言密教の立場から説かれた神仏習合思想）との関係から奈良や醍醐寺系の僧侶が三社託宣の製作に関与していたのではないか、ともいわれています。