もちろんある。

公理的ZF集合論の立場では、万物は集合で集合で無いものは存在しない。
0も1もπも集合。

素朴集合論はそこら辺がぼやかしてあって、集合で無い原子の存在を仮定するのかしないのかはっきりしない。