生物兵器コロナウィルスのスレその4

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/07(土) 23:43:25.87

C28144T

日本バイオデータ@info_nbd　3月5日
https://twitter.com/info_nbd/status/1235230241292984320?s=21

http://imepic.jp/20200305/305800

【集合知】新型コロナウイルスの「Ｌ亜型」と「Ｓ亜型」について、５ちゃんで考察
https://www.news-toranomaki.net/?p=3477

ゲノム
https://i.imgur.com/50gwbEM.jpg

なるほど意味が分かってきた
https://twitter.com/5chan_nel (5ch newer account)

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/07(土) 23:48:04.59

Ｌ亜型とＳ亜型は
株式会社日本バイオデータが出している情報の
CTC、TCC、TCT
これは
８７８２、２８１４４、２９０９５だな

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/08(日) 00:02:46.32

CTC、TCC、TCT　この記号の真ん中が「Ｔ」か「Ｃ」で
Ｌ亜型とＳ亜型に分けるんやね

28144は
Ｌ亜型がT
Ｓ亜型がC

なんや、小学校３年までの算数オリンピック　キッズＢＥＥぐらいの分類
症状とゲノム解析を関連づける作業です

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/08(日) 00:12:00.81

これ症状とゲノムの情報が集まってる厚生労働省がやれば
症状との関連付けで対症療法が有効に近づける可能性は？

とわ言え、右レッド左グリーンの入り口に完全レッド判定が存在では
何を伝えようとすれば良いのか思案してしまいます

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/08(日) 00:27:36.55

今、株式会社日本バイオデータの情報では
東京がＳ亜型
京都と愛知がＬ亜型
ここまでは、ある程度正しいと思われる情報か？

関連ニュースに書かれている（ちょっと編集あり）

＞東京　Ｓ亜型（セリン）＝ＴＣＴグループ　が「弱毒性」
＞京都と愛知　Ｌ亜型(ロイシン)＝ＣＴＣグループであり「強毒性」の「武漢ウイルス」が疑われる？！

で、
Ｓ亜型（セリン）＝ＴＣＣグループは、ちょい上のツリー国内情報が無いので
そこには触れてないみたいだな

>>218　から　データ拾って　28144　拾えばいいのか
バイナリエディタか何かで拾えそうな感じ

◆.FOLOArVkQqD (イスラエル国) · 2020/03/08(日) 00:28:20.81

連投ですね

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/08(日) 00:49:18.74

ＧＩＳＡＩＤから
＞https://www.gisaid.org/

右上のをクリックして、新しい画面に映ります
＞Genomic epidemiology of hCoV-19

右にツリーが見えてますよね
そのツリーを下に移動して、仮に愛知をフィルターでかけるとして
「Aichi (1)」をクリックしてください
＞Filter by LocationClear location filter
＞Aichi (1)

画面上のツリーに戻ると、Aichi (1)だけが色付き太線で表されます
その右端にポインター（マウス）を移動させると太丸に変化するので
そこをクリックすると、以下の表示がでます

ここまで出来ましたか？

＞Japan/AI/I-004/2020
＞
＞Collection date 2020-01-25
＞Authors Sekizuka et al
＞Age 48
＞Country Japan
＞Admin division Aichi
＞Host Human
＞Location Aichi
＞Originating Lab Department of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
＞Sex Male
＞Submitting Lab Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases
＞GISAID EPI ISL 407084
＞Genbank accession LC521925

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/08(日) 00:55:18.75

ここで最下行右の「LC521925」がクリックしてください
＞Genbank accession LC521925

新しいページが開きます

このページに最上行に
＞GenBank: LC521925.1 (click to see this obsolete version)
があり、「LC521925.1」を更にクリックします

今、このページが表示されていすよね？
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LC521925.1?report=genbank

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/08(日) 00:56:44.40

ここで、28144が調べられるのかは謎
ちょっと見てきます
頭が痛いので寝落ちしそうです
起きていましたら、またあとで！

◆NVCktpNSH.9. (福岡県) · 2020/03/08(日) 01:21:40.67

たぶんこれか？
バイナリエディタなしでも大丈夫そうだ

28141 aacctaaatt gggtagtctt gtagtgcgtt gttcgttcta tgaagacttt ttagagtatc

連番でしょうから28144は「Ｃ」！？
違うな

日本バイオデータのツイッターでは２月２０日に指摘とある

ＧＩＳＡＩＤは
＞Collection date 2020-01-25

違うゲノムなのか？

ＧＩＳＡＩＤのデータから
ACCESSION LC521925
VERSION LC521925.1
とある。VERSION違いか？

これ以上、確認できる情報があるのかは謎だが起きてたらまた