もうすぐ専門学校に行くんたよね？？
元々不登校だったわけだし、しばらく間が空いているので、最初のうちは人間関係や、他のことで困ったりすると思います。
その上で、今もお母様のことで悩みを抱えていて
ということを書いてる状態で専門学校に行ってもまた、限界が来ちゃって、学校に行けなくなっちゃったり、病気の症状がもっとひどくなってしまうかもしれない。

だから一人暮らしを始める前に、お父さんは今の気持ちを相談をしても良いんじゃないのかな？？

お姉ちゃんが中学生の頃、敵対心を抱いたり反抗していたように、家族として ある程度の喧嘩はしてもいいと思うし、それで関係が簡単に壊れることはないと思うよ。