「良かったですね」は禁句だと思う。
「(怪我して)良かったですね」に聞こえるんだよ。
あとは完治してなくても退院という人もいて、病院でできることがありませんから出てって下さいね、って場合もあるからめでたくない事も多々ある。

相手の状態わかるならそれに合わせて
「良くなりそうですか？」とか
「お疲れさまでした。大変でしたね」
辺りでいいんじゃないかな。