まぁ難しく考えるなくていいんじゃ〜？
とりあえず現時点わかっている穴とかスキマだけでもパテでうめていけばいいし〜
http://www.cemedine.co.jp/product/domestic/putty/wood_putty.html
これね〜↑
でまた気づいたらやると〜
最初から完璧目指すと疲れるよ〜