>>150にインライン追加すると

本領認識しない系の修正。これで一括訓練は動く
ixa-training.user.js内のUtilメンバgetVillageList内の var list=[]; の後に、

var $cap = $('#sideboxBottom div.my_capital li');
list.push({
id: $cap .data('village_id'),
name: $cap .children().eq(0).text(),
x: $cap .data('village_x'),
y: $cap .data('village_y'),
country: $cap.data('village_c')
});

を追加。
:ttps://gyazo.com/82bde6b5a0de86ca83c44fdb3b47190f

ixa-moko.user.jsのgetFacilitys内の
「// 存在しない拠点データは削除」部分のforループ内if文を

if (!$('div.my_country li[data-village_id="' + key + '"]').length && !$('div.my_capital li[data-village_id="' + key + '"]')) {

:似た行をコメントアウト(消してもいい)して
:ttps://gyazo.com/a7debdbd5c5bb4c608031e13ff424968

と変更。
ついでに国リスト

15: { 1:"足利家", 2:"北条家", 3: "尼子家", 4: "安東家", 5: "蒲生家", 6: "本願寺家",
7: "小田家", 8: "村上家", 9: "松永家", 10: "長宗我部家", 11: "相良家", 12: "豊臣家" }
:ttps://gyazo.com/561aee025e9194eb37a836b7144c7b28

:これで出来ない奴はまとめてくれる神様待った方がいい