HTM大脳新皮質のみをモデル化したアルゴリズムという、誤解がよくあるが、それは間違い。

>5. 人間の脳の動作原理から、「知性」ある機構を学びとるには(完全な忠実な模倣が目的ではない)、
海馬、幹脳、中脳など、大脳新皮質以外にもアーキテクチャに取り込むべき脳の部位はあることは承知している。
が、最も大事なのは大脳新皮質なので、さしあたり優先度No.1として、大脳新皮質をモデル化した、とのこと。
http://qiita.com/HirofumiYashima/items/ff3ec6f61252fcf7ca29