CLIのみでDRM解除するには、DeDRMプラグインの中の
DeDRM_Windows_Application/DeDRM_App/DeDRM_lib/lib
にあるscriptinterface.pyがキモ

この中にあるメソッド
def decryptk4mobi(infile, outdir, rscpath):
を呼び出せばDRM解除できる

infile: 入力ファイル
outdir: 出力ディレクトリ
rscpath: 鍵ファイル（*.k4i）が格納されたディレクトリ

鍵ファイルがあればどのマシンでも解除可能
Linuxの場合はpython, python-crypto, python-lzmaが必要
lzmaは実際には使われないのでlib/ion.py内でimportしてるとこを
コメントアウトすれば不要になる

という話が通じる人は参考にしてください