>>767
AcrobatというアプリとPDFというファイルは別のものとして考えないと答えは出ないよ。

PDFは基本的にただのコンテナ。いわばZIPとかと同じカテゴリ。
文書としての体裁を保つための規定が細かくあるが、それさえ守っていれば何をどう入れてもいい。
ビュワーアプリがそれを表示できるかはまた別だけど。

AcrobatはPDFをつくるためのアプリ。
Acrobatの方針として見えるのは最終的な体裁に合わせるためなら元データの維持は重視されていない。
だからデータを勝手にいじらないような設定をあえて指定しないと最終形態に合わせて勝手にデータをいじられてしまう。

もちろん元データをいじらずにPDFという形にまとめるだけのアプリもある。