疑問に応えて頂くかアドバイスを頂けたらと考えます。

ガーバービュー（データ）の違い
https://imgur.com/a/X0B8SUs

上の画像の順番は下です。
KiCADで作成しガーバーデータをオフライン（GerbView)で見ました
KiCADで作成しガーバーデータをオンライン（SEEED）で見ました
eagleで作成しガーバーデータをオンライン（SEEED）で見ました

リンクに貼った画像のように74シリーズTTLをKiCADオンラインで見た時に
穴（ドリル）が無いでので、どこに問題があるのかと考えています。

なお、KiCADで作成したガーバーデータをオンライン（SEEED）見た日時は今日です。
また、eagleで作成したガーバーデータをオンライン（SEEED）見た時期は昨年です。