>>514
バイスを工夫して２面拘束できるようにするとか。
加工後にバイスを緩めてワークを90度回せば1軸の原点は変わらず、2軸の原点はワークの厚みだけずれる。

ワークの形状に合わせてＸとＹどちらを優先すれば良いか変わります。

他にはワークは付けっぱなしで、イケールに位置決めピンを付けて90度ずらせば良いと思います。

精度を要する方を先に加工し、ボール盤でOKな横の穴あけした方がよいですね。