Eagle6を使っていますが、SMDのパッドサイズとCreamのサイズを別々に設定
することは出来ないんでしょうか？

実際の現場だと多分Padサイズ=Creamサイズのガーバを作ったうえで、メタル
マスクを作る際に開孔率80%とか指定出来るんでしょうけど、今時の格安PCB屋で
メタルマスクを作るときにそこまで指定できないのでEagleのLibを作る時点で
creamをpadに対して小さめに設定しておきたいんですが。