ポイントの付き方について結論を言わせてもらうと、1000円未満でもポイントはつくが、
通常ポイントと優遇ポイントは別計算で、それぞれにポイントが算出される
たとえばセブンで500円の場合、JCBカードWなら以下の合算で1ptになる
通常ポイント：500/1000=0.5→0pt
優遇ポイント：500/1000*(2+1)=1.5→1pt

なお、優遇ポイント同士なら、倍率が違っても小数点以下まで1か月分合算してくれる
W使ってセブンで250円、シェルで750円使う場合、
通常：(250+750)/1000=1→1pt
優遇：250/1000*(2+1)+750/1000*(1+1)=2.25→2pt
で合計3ptになる