直営の多くは「そのままオーナーに渡しても利益を出せない店」「前オーナーが諸事情(体調不良、契約解除、不祥事など)で引退して、
次オーナーへ引き渡すまでに店の状態を整える店」「社員や他店舗スタッフのトレーニング、販促展開のサンプルに使うための店」など、事情は色々とある

直営かFC店かの区別は外観やスタッフだけだと判別は難しいけど、独自色を強く出しているならそれはオーナー店の可能性が高い