確定申告書等作成コーナーで書類作成して所轄の税務署に提出する

https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/shinkoku/tokushu/iryouhikoujo2.htm

年末調整後に会社から配布される源泉徴収票と医療費の領収書を準備しておく
後はそれ見て入力するだけで簡単に確定申告の書類が出来る

担当の税務署職員が頭カチコチの化石頭でもない限り、診断書の添付は必要ない