自分も2年前ぐらいに炭の効果を見て竹炭パウダーを試したことあった。
当時途中でやめたのは神経質なので副作用とか色々調べてたらごく一部の記事で吸着作用が強いゆえに栄養素や悪い油と一緒にオメガ3とか良い油も吸着してしまうんではというのがあって短期間だったので効いてるかも分からず何となく辞めてしまった。
上の人の見てもう一度調べたらクレンジルと別の薬用炭の注意書きに

球形吸着炭:クレメジン
注意
【診察で】
他の薬の効き目を悪くします。別に薬を飲んでいる場合は、医師に教えてください。
【飲み合わせ・食べ合わせ】
吸着作用があるので、基本的に他の薬との同時服用は避けます。30分〜1時間以上あけてください。

ってのがあったから、恐らく飲み合わせや食べ合わせの時間を近くすると薬の成分や栄養素とかの一部を吸着してしまう可能性があるんかなって。
まあでも薬用炭としてもこうやって使われてるわけだから注意守って食後は30分〜1時間ずらしたり、上の人の言うように食前とか用法用量を守って飲めば大丈夫なんだと思う。

横から水を差すようなことを書いてすいません。
結論として、時間帯や用法用量守れば副作用は気にしなくても良いと思うのでそれよりIBSのほうが辛いからこっちに効けば良いので上の方の書いてるクレンジルを自分も試してみようかなって思います。

http://www.interq.or.jp/ox/dwm/se/se39/se3929003.html