矛盾してないと思うよ
傾向として虫歯菌の割合が多い人は歯周病菌の割合が少ない分、歯周病になりにくいけど、

少ない割合の人はでも凶悪菌（ジンジバリス菌など）を持ってる人とかは、結局不幸が起きるということでは。

虫歯菌はメイン二種類だけど歯周病菌はたくさんあるから、分かってないことも多いんだと思う