まだまだエビデンスが足りてないけど
アトピーの人は毛量が減ることで炎症が起こりにくくなったり
C繊維が短くなって痒みが減ってる症例が学会で次々と発表されてる

あとはアトピー関係ないけど皮膚全般でいうと
顔の産毛が毛穴に雑菌を導いてニキビが出来るし
脇毛や陰毛は汗が乾きにくいから雑菌が繁殖する
脱毛すると毛穴も締まって雑菌も繁殖しにくくなる

アトピーこそ医療脱毛した方がいいと俺は思う