クジラも前肢がヒレ状だが後肢は退化している。それに対して鰭脚類は４本の肢がすべてヒレ状で残っている。
また、クジラは出産や子育てを含めて一生を水中で過ごすのに対して、鰭脚類、カワウソ、ラッコなどは出産は陸上で行う。
クジラの海生としての歴史は5300万年だが、鰭脚類は最古のエナリアークトスでさえ2700〜2500万年前のため水中適応に差があるのだ。