SuicaやPASMOアプリケーションはけっこう容量食うので、
それとAMCアプリケーションが入っているところに、更にiDやQUICPayを入れるのはさすがに厳しいのではないかと思います。

容量小さめ、全国利用未対応な交通ICとQUICPayとかだったら実例あるのですが...
http://www.valueone.cc/inc/pdf/PASPYHIROCA.pdf

Kitacaも厳しそうな雰囲気です。
http://www.jr-tower.com/about_card