「Kobo集英社問題」は、epubの構造が他とちょっと違うんだな。通常は、

META-INF/container.xml
↓
opfファイルの<package><spine><itemref>
↓
opfファイルの<package><manifest><item>
↓
xhtmlファイル
↓
jpegファイル

なのに集英社のはxhtmlがなくてopfから直接jpegを参照してる。
<package><manifest><item>のメディアタイプは画像もOKらしいので
別にルール違反でもない気がするが、calibreビューアでは開けない、と。

kinoppyやfoliate-jsでは普通に開くのに。