公文書管理をめぐる衆院予算委員会の集中審議で佐伯耕三・首相秘書官が野党議員にヤジを飛ばした問題で、
西村康稔官房副長官は2018年4月12日、佐伯氏を厳重注意したことを明らかにした。ヤジを飛ばされた希望の党の玉木雄一郎代表は
「国会をナメるなと言いたい。無茶苦茶」と怒り心頭だが、佐伯氏については「とても優秀でざっくばらんな関西人」といった別の評価も聞こえてくる。
玉木氏は2018年4月11日の集中審議で、玉木氏の発言中に佐伯氏が「違うよ！」などと発言したとして、
「秘書官がヤジを飛ばすな！」と激高。その後もツイッターで「安倍総理は総理席からよく野次を飛ばすが、
秘書官も飼い主に似るということか。総理秘書官がヤジを飛ばすなど前代未聞の不祥事。
国会をナメるなと言いたい。無茶苦茶」などと怒りをぶちまけた。佐伯氏は灘中高から東大を経て1998年に経済産業省に入省。
経産相出身の今井尚哉秘書官の16年後輩にあたり、2人は第1次安倍政権でも一緒に官邸で働いている。
第2次安倍政権では内閣副参事官として安倍晋三首相のスピーチライターを務め、「知る人ぞ知る黒子」（2016年6月21日、日経電子版）
「安倍の演説に各省の主張の継ぎはぎ色が薄く、良くも悪くも個性が出るのは、宰相の言動や心境をつぶさに観察する書き手のなせる技だ」（同）
と評された。佐伯氏が秘書官に抜擢されたのは17年7月。当時佐伯氏は42歳で、事務担当の首相秘書官としては最年少だった。
なお、佐伯氏がヤジを飛ばしたのは、今回が初めてではない疑いがある。立憲民主党の蓮舫参院議員は、
4月13日、18年2月26日の衆院予算委員会のものとみられる議事録の写真つきで、「経産省の佐伯秘書官の野次。
2月には長妻さんにも野次っていました。事務方が国会で質問議員に野次とはあり得ない。
本人は『首相への助言』と言うが1mも離れた自席から助言など、ない」などとツイッターで非難。
議事録では、長妻氏が「いや、秘書官の方が今やじをおっしゃるので、何ですかね」「ちょっと秘書官の方、
気になるのでやじをやめてください」と訴えている。この2件以外にも、過去の国会議事録から確認できる限りでは、
16年10月27日の衆院TPP特別委員会で、民進党の福島伸享議員が「何か後ろから秘書官がやじるんですよ。
前代未聞ですよ。秘書官がやじるのはやめてくださいよ」と発言している。