理系(特に実験系)ならいきなり新しいことやるのは厳しいから、学部では研究室でやってるテーマから切り分けた一部分、修士でそこから発展させたテーマって感じで論文書くことにはなるけど
文系の院生の論文のテーマなんかボスに強制的に決められるものでもないやろ？