確かにAmazon Kindleが自動アップデートの対象にされていて、それを対象外にするオプションはあったけど winget upgrade --all の時にアップデートされなくするだけであって、
アプリ自身が持っているアップデート機能を停めることはできないのではないかな?

自分はワイルドカードを使って かつ 子プロセスまで強制終了できるバッチファイルの作り方をcopilotにきいて一応作っておいた
そして"*KindleForPC*"と"*installer*"とを強制終了できるようにした