ズレてるかもしらんが、グレースケールで取り込んどいてソフトで一括モノクロ2値化したらダメなの？
通常はモノクロ版で読んでて綺麗なグラフや写真見たい時だけグレスケファイル開く

ファイルサイズだけの問題ならいずれ時間が解決すると思って俺はグレスケかカラーでしか取り込まないし、実際時間が解決してくれていつも取り込む作業ばかりしてる(´・ω・｀;)