集英社側が拒否する理由の方が無いと思うけどな
売り手側から御社とは取引できませんな、とか言うわけないし
その気になればメディアドゥとかの取次を介せばいいし

まったくの想像だけど、電子書籍黎明期の2000年前後は
電子書籍なんてものすごく小馬鹿にされてて電子化の許可もらうのも大変だったらしいから
その頃に何か屈辱的な扱いをされて意地でも集英社は取り扱わんぞと心に決めてたとか
何か因縁めいたものがあったんじゃないかなーなんて思ったり
まったくの妄想だから本当のところはわからんけど