レスをくれた方、ありがとうございます。

>>715
TTL仕様のFPGA（ ←→ PC ）と言うのがUSB接続（USBハブから電源を供給）で
自分が製作したTTL回路とパラレル通信を行ってます。TTL仕様のFPGAと言うのは
具体的にはFT245RLですが自作TTL回路とはどうしても別電源になってしまいます。
イメージとしてはUSBでプリンタ（パラレル）と通信する感じです。

>>716
回路は下です。74LS74からFT245RLの「WR」へ書き込み用の制御コード（順にhi、low）を
送ってますけど蛍光灯の点滅時には意図しない書き込み（hi、lowを確認済み）シーケンスが発生します。
物理的な問題でFT245RLの配置を変えた際に1個のコンデンサが役に立ってない感じになりました。
https://imgur.com/a/BL8df

＞FPGAは入力かな？
＞だとしたらプルアップ抵抗つけたらどうだろ？
74LS74からFT245RLへの入力です。
プルアップ抵抗ははTTLとCMOSの接続時ように電源（5V）を繋げて抵抗を繋ぐ感じでしょうか？