差動信号の特性インピーダンスについて教えてください

イーサネットCAT5を満たすのが目的です

グランドの名前と意味は下記です
FG=装置フレームグランド
アースに接続

SG=シグナルグランド
マイコンなどのGND
FGとコンデンサ(4700p程度)で結合

装置外のケーブルのシールドはFGで片側接地されています
CAT5なのにFGのよるシールド付きなのは客先指定です

装置に入り、中継基板を経由して、マイコン基板内のパルストランスで絶縁しています

中継基板及び、マイコン基板のトランスまでの間のインピーダンスは下記にしたい場合、
内層のベタはSGなのでしょうか？FGなのでしょうか？

差動インピーダンス100Ω
シングルエンドインピーダンス50Ω

SGとFGの間がコンデンサでつながっていて、高周波はすべて抜けるからどちらでも良いのでしょうか？