俺が違う回路と思い違いをしているかもしれません。

もし図のような回路なら、下記のようなことではないの?

・発振前(FETもOFF) はVOUTは0Vなので、青の経路でC1にチャージされます。これがFETのゲート電圧になります。

・発振後のときのFET OFF時は、Sの電圧は、グランドより、VF分低い電圧になり、
GND>Sの電圧なので、D2には赤の電流が流れます。(因果関係が逆で、赤の電流が流れるから、GND>Sですね)
同時にVIN > S なので、C1にチャージの余地があれば、青の電流も流れてC1にチャージされます。…★


>>511が言ってる
>ダイオードがオンならほぼグランドの電位なのだからブートストラップ コンデンサを充電できるよね。
は★のことで、
>同期整流はダイオードの順方向電圧分を節約してるだけだから。
は、FET OFF時に、Sの電圧が、GNDに対してVF分マイナスにならずに済む、ということだと思う 。
ところが、それに対して、>>513において、>>511にアンカーを打って、
>確かに電位はグランドレベルからVf分高いだけなんだけど
という文言がある。
でも、この回路にはグランドレベルからVF分高くなる部分はないはず。