どんだけ面倒くさがりなんだよ

店員したことないから詳しくはわからんがあれって何を読み込ませるかを店員に伝え店員が読み取り端末を起動ないし読み取れる状態にするんじゃないの?
そこで何を読み取るのかを店員側で操作してるんじゃ?

例えばEdyにしろ何にしろ読み取れる端末が置いてあるがあれの本体部にEdyだの楽天ポイントだの各対応した電子マネーやポイントカードのロゴマークを印字しておく

楽天ペイの場合は客はレジに行き端末にある楽天ペイのボタンをタッチする
選択に間違いがないかどうかのYES or NOが表示され間違いがなければ自分でYESをタッチ

後はバーコードを表示した画面を店員に向ける
店員はその表示されたバーコードをピッと読み取るだけ

それかレンタルショップみたいなゴツいのでなくていいからセルフでバーコード読み取りできるようにするとかでもいいとはおもう