220です。

結局、何か特定の菌が発見されたから抗生物質を処方されたわけではなく。
検査で異常なし、体質で下痢をしやすいのでもなく、精神的に不安定ということもない、
などの状況証拠から小腸にいる菌(大腸かもしれないけど)が原因なのだろうと医者が判断してくれました。
ただ、総合病院や近所のクリニックでは普通の治療ではないので抗生物質は処方できないと断られ、都内の病院で処方してもらいました。